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Pflanzen-Genomforschung
Themenbereiche Umwelt-, Ökologie- und Agrarwissenschaften  


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BMBF - Projekt: MIMAS - (M)ikrobielle (I)nteraktionen in (MA)rinen (S)ystemen


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  PROJEKT: Das zentrale Anliegen dieses Projekts ist die nachhaltige Etablierung moderner genomischer und molekularer Techniken in der nationalen marinen Ökosystemforschung. Dazu soll die mikrobielle Diversitätsforschung mit den Techniken der Proteom- und Transkriptomanalyse sowie mit metagenomischen in situ Verfahren gekoppelt werden, so dass die Komplexität der mikrobiell dominierten Stoffkreisläufe in marinen Ökosystemen methodisch in einer neuen Dimension erfasst werden kann.

Im Mittelpunkt des Vorhabens steht die Entwicklung von neuen molekularbiologischen Techniken zur Erfassung des Metatranskriptoms und Metaproteoms mariner mikrobieller Gemeinschaften. Die Eignung dieser molekularbiologischen Techniken als zukünftige Werkzeuge zur Analyse bakteriell mediierter Ökosystemfunktionen soll an ausgewählten marinen Modellstandorten übergeprüft werden. In der umfassenderen Analyse der genomischen Diversität und Aktivität mariner Mikroorganismen liegt der Schlüssel zu einem besseren Verständnis von Klimaveränderungen und anderen anthropogenen Einwirkungen (z. B. Eutrophierung) auf biogeochemische Stoffkreisläufe.

Durch eine umfassendere, kultivierungsunabhängige Bestimmung der Zusammensetzung und Funktion mariner mikrobieller Gemeinschaften mittels einer kombinierten Metagenomik, Metatranskriptomik und Metaproteomik werden neue Erkenntnisse über ökophysiologische Leistungen und Anpassungen von Mikroorganismen in marinen Ökosystemen erwartet. Anhand der vertieften funktionellen Genomanalyse ausgewählter mariner Modellbakterien sollen umweltrelevante Markergene bestimmt werden. Durch die parallele Erfassung biogeochemischer und genetischer Parameter sowie einer anschließenden Integration derselben wird ein verbessertes Monitoring mariner Ökosysteme erwartet.


Projektdetails

Akronym: MIMAS
Projekt-No.: 03F0480A
Projektleiter: Prof. Dr. Thomas Schweder
Laufzeit: Oktober 2008 - September 2011
Fördervolumen: 442.890 Euro
Beteiligte Projektpartner: 5
Web: http://www.marine-biotechnologie.de




Herr Prof. Dr. rer. nat. Thomas Schweder - Leiter der Pharmazeutischen Biotechnologie
Abteilung Pharmazeutische Biotechnologie
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät (Ernst Moritz Arndt Universität Greifswald)
Tel.: +49 3834 864 212
Fax: +49 3834 864 238
E-Mail: schwederuni-greifswald.de

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